借助DS的机能，风景更加绚丽，神兽出场画面变得充满魄力，增加了很多触摸屏的新设定，时间和昼夜属性在DS系统上显得更加合适，全新的剧情全新的人物。精灵数扩充到493只，同时珍钻又是神兽大爆发的一作，光可以捉到神兽就有原先的一倍多。再加上活动所得的精灵，使得本作又是一个里程碑，活用了DS的无线和WIFI系统，本作的交换对战变得更加随意。同时可以用联动公园，利用DS的GBA卡槽与GBA前作进行联动。
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